Jednym z przełomowych wydarzeń w historii botaniki było odkrycie komórek w korku oraz w żywych tajnikach. Dokonał go Robert Hooke, a pomógł mu w tym prosty mikroskop. Urządzenie to następnie przyczyniło się do zbudowania fundamentu pod anatomię i morfologię roślin. Dziś mikroskopy wykorzystywane są między innymi do badań budowy i funkcjonowania komórek roślinnych, budowy tkanek i organów wegetatywnych, a także badań cytologicznych, histologicznych, czy embriologicznych roślin.
